Pegasus Mail affiche une interface très minimaliste. Conséquence : l’accès aux commandes et aux dossiers de courrier n’est quasiment jamais direct. La barre de menu Elle comprend l’accès à toutes les commandes du logiciel. La barre d’outils Elle contient des accès aux commandes les plus fréquemment utilisées. Vous pouvez la personnaliser. 
La zone principale Elle permet l’affichage des différents dossiers et des messages.Dans Pegasus Mail, chaque dossier et chaque message peut être affiché dans sa propre fenêtre. Il peut donc y avoir de nombreuses fenêtres ouvertes. La barre d’état Elle fournit des informations sur l’activité du logiciel ou sur le nombre de messages.
Les fenêtres de dossier
Les fenêtres de dossier (une fenêtre pour chaque dossier, répétons-le) affichent la liste des messages qu’ils contiennent. Vous pouvez, comme dans tous les logiciels, cliquer sur le titre d’une colonne pour classer les messages selon le contenu de cette colonne (expéditeur, objet, date, taille, etc.). Dans la première colonne, le signe 
signifie que le message a été lu, 
que vous y avez répondu. Les flèches (par exemple 
), indiquent la priorité du message (urgent, etc.).
